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福建漳江口紅樹林國家級自然保護區(qū)（簡稱漳江口保護區(qū)）位于福建省漳州市云霄縣漳江入海口。最近城鎮(zhèn)為云霄縣城，位于濕地以西 10km，東北向距離廈門約 85km。主要保護對象以紅樹林濕地生態(tài)系統(tǒng)、瀕危野生動植物物種、東南沿海水產(chǎn)種質(zhì)資源為主。主要濕地類型有紅樹林、灘涂、水域或組成的河口濕地等。符合《濕地公約》國際重要濕地指定標(biāo)準(zhǔn)的 1、2、3、8。保護區(qū)于 1992 年元月成立，1997 年 7 月經(jīng)福建省人民政府批準(zhǔn)為省級自然保護區(qū)，2003 年 6 月經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)升格為國家級自然保護區(qū)，2008 年被列入《國際重要濕地名錄》 。

漳江口保護區(qū)總體上由河口水域、 潮間帶森林濕地（紅樹林沼澤） 、灘涂（潮間帶泥灘）和鹽沼組成，其中最主要的濕地類型為永久性的、以紅樹林植物秋茄、桐花、白骨壤等為建群種的紅樹林灘涂濕地，占濕地總面積的 55%。

漳江口保護區(qū)內(nèi)植被類型分為紅樹林、濱海鹽沼、濱海沙生植被3 個植被型，有白骨壤林等 13 個群系，有秋茄—老鼠 等 22 個群叢。區(qū)內(nèi)有維管束植物 224 種，有紅樹植物 5 科 6 屬 6 種，鹽沼植物 16 科27 屬 29 種 1 變種，濱海植物 59 科 152 屬 184 種。區(qū)內(nèi)營養(yǎng)豐富，從而微生物資源豐富，有微生物 12 科 27 屬 45 種，與陸地生境的微生物數(shù)量比較，紅樹林土壤細菌數(shù)量高于一般陸地生境，而土壤放線菌、真菌數(shù)量較少是漳江口紅樹林國家級自然保護區(qū)土壤微生物數(shù)量分布的主要特征。

漳江口保護區(qū)已查明野生脊椎動物共 359 種，其中哺乳動物 9科 14 種，鳥類 38科154種，爬行類 11 科 37 種，兩棲類 5 科 13種，魚類 141 種。列入國家一級重點保護的動物有中華白海豚和緬甸蟒蛇2種， 列入國家二級重點保護的動物有寬吻海豚、 黃嘴白鷺、 小杓鷸、小青腳鷸、綠海龜、棱皮龜、太平洋麗龜、虎紋蛙等 19 種。省級重點保護動物 24 種。保護區(qū)鳥類中具有眾多的雙邊國際性協(xié)定保護的候鳥，其中中日候鳥保護協(xié)定保護的鳥類 77 種、中澳候鳥保護協(xié)定保護的鳥類 41 種。保護區(qū)紅樹林區(qū)潮間帶底棲動物 28 種。潮下帶底棲生物 181 種。海區(qū)浮游植物 201 種，其中硅藻 165 種。浮游動物 180 種，其中水母類 59 種，橈足類 71 種。

漳江口保護區(qū)屬于亞熱帶海洋性季風(fēng)氣候， 氣候溫暖濕潤， 光、 熱、水資源豐富。根據(jù)1960～1999年的氣候資料統(tǒng)計，年均氣溫21.2℃，極端最高氣溫38.1℃，極端最低氣溫0.2℃。最熱月份在7～9月。年平均降水量為1714.5mm，年最高降水量2493.2 mm，最低降水量1348.4mm，降水主要集中在 4 ～ 9 月。年蒸發(fā)量 1718.4mm，年均相對濕度79%。年均日照時數(shù)為 2125.1h。年平均霧日數(shù) 7.7 天。

漳江口保護區(qū)內(nèi)紅樹林濕地地勢自西北向東南表現(xiàn)出明顯的階梯狀降落，形成東、北、西三面高，中部及南部地勢開闊平坦的地貌。漳江下游河口區(qū)地帶母質(zhì)為第四紀(jì)殘積物質(zhì)和沉積物質(zhì)，由古老沖積物、近代河流沖積、海積和風(fēng)積形成。土壤為濱海灘涂淤積和沙質(zhì)淤積，厚達2m以上。土壤基質(zhì)顆粒精細無結(jié)構(gòu)，通常是半流體而不堅固，含高水分，缺乏氧氣，土壤呈還原狀態(tài)，具沼澤化特征 ；土壤含鹽量高（一般在1%以上） ，具鹽漬化特征；土壤 pH3.5 ～7.5，呈較強的酸性，土壤含有豐富的植物殘體和有機質(zhì)，有機質(zhì)含量平均為 4.48%。土壤中也含有大量的鈣質(zhì)。

漳江為云霄縣的主要河流，全長 58km，最終匯入東海東山灣。流域面積 855km²，由安厚溪（平和縣） 、馬鋪溪、下河溪、和平溪、南溪、火田溪匯合組成。年平均徑流量 6.35 億 m³。漳江上游無大中型工業(yè)，海域溶解氧（DO）年平均含量為 7.3 mg/dm³，活性磷酸鹽年平均值為0.38μmol/dm³，總氮含量全年平均為 7.25μmol/dm³，化學(xué)耗氧量含量變化范圍為 0.58 ～ 2.31μmol /dm³，總懸浮物含量范圍為 1.9 ～ 18.32mg/dm³，油類含量平均值為 23.3μg/dm³，常年水質(zhì)為 II ～ III 類水質(zhì)。海域的 pH 變化范圍為 8.02 ～ 8.45，水溫變化在 14.85 ～ 25.56℃。海域?qū)俨灰?guī)則的半日潮形成，平均潮差
2.32m，最高潮位 7.7 m，最低潮位 3.03m。

漳江口保護區(qū)位于臺風(fēng)多發(fā)區(qū)，1955 ～ 1980 年間影響云霄的臺風(fēng)達 150次， 年平均臺風(fēng)影響 5.8 次。紅樹林濕地是該區(qū)域的保護者，在穩(wěn)固海岸、抵抗臺風(fēng)侵蝕方面有重要作用。