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全球變暖、氣候變干等自然因素直接對濕地進行肆虐，同時城市擴張、過度放牧、開采泥炭、挖溝排水等人類活動也強烈地摧殘著脆弱的高原濕地，使得高原濕地生境惡化。在自然因素和人為因素的綜合作用下，高原濕地退化現象日趨顯著，高原濕地在痛苦地呻吟，為其當今的處境而悲泣。許多高原濕地的面積都呈縮減的趨勢，尤其是泥炭沼澤濕地潛水位下降明顯，有些泥炭沼澤濕地已經疏干，變成泥炭裸地；青藏高原濕地土壤已出現鹽漬化現象，形成鹽化泥炭土和鹽化草甸沼澤土；湖泊濕地也呈現出礦化度升高、湖水退縮、地表出現鹽霜的現象。僅青海湖濕地區，在 1987 ～ 2000年間湖體內外的水域已有 7810hm²變為了流動沙地，有 1550hm²沼澤變為了流動沙地，湖泊濕地荒漠化加快。蒙新高原的湖泊濕地萎縮、水質咸化趨勢更為明顯；云貴高原的許多湖泊還在遭受著嚴重的污染侵害。

黃河首曲濕地位于四川省西北部及甘肅省東南部的交界處，地處黃河上游、青藏高原的東側，橫跨四川省的若爾蓋縣、紅原縣、阿壩縣、松潘縣和甘肅省的瑪曲縣和碌曲縣，總面積約 1600km²，平均海拔 3500m。黃河首曲濕地是黃河上游重要的水源涵養地，不僅對整個黃河流域水資源的調節起到關鍵作用，對當地的氣候也起到重要的調節作用，也是中國最大的高原沼澤植被集中分布區，具有不可替代的生物多樣性價值。但由于該區以牧業為主，人口的不斷增長加大了放牧的力度，使該區草場嚴重超載，尤其在 20 世紀 70 年代，為了緩解草場的壓力，對“環境惡劣”濕地進行了大規模的挖溝排水活動，將濕地改造為牧場，導致濕地大面積消亡。與以前相比，若爾蓋地區野生動物種類和種群數量都明顯減少；而草場植被不僅覆蓋率下降，而且有毒有害植物不斷增多，大部分草場的毒害草、雜草類由 20 世紀60 年代的 20％上升到目前的 70% ～ 80％；沼澤積水也明顯減少，目前夏季沼澤水深多在 10 ～ 15cm，更多的沼澤僅呈過濕狀態。尕海地區草地已不堪重負，不少地方已經裸露沙化，風吹沙起，而更多的地方也由過去的“風吹草低見牛羊”的美麗風光變成了“風吹草地見牛蹄”的慘景。昔日的大片沼澤地也變成了植被稀疏且草質很差的半干灘， 大部分山谷小溪徹底斷流， 數千眼泉水干涸，大小湖泊水位明顯下降。而中華鼢鼠、旱獺、野兔等動物的洞穴卻如滿天繁星， 不計其數， 使整個草地千瘡百孔，滿目瘡痍，鼠蟲害面積擴大又加快了濕地的水土流失。過去 50 年拉薩城市用地變化進程表明拉魯濕地面積在 1959 年的濕地面積為 1000hm²左右，到 1965 年減至 864hm²，1999 年進一步縮減到 548.7hm²，減少了約 40％。199l ～ 1992 年，在拉魯濕地修建的貫穿東西的中干渠造成濕地排水迅速，導致濕地旱化和沙化。在近 40 年來人為干擾下，植被群落由蘆葦群落演替為小花燈心草—槽桿荸薺群落，植被高度由 1 ～1.2m 變為 0.1 ～ 0.2m。

退化中的若爾蓋高原濕地(高俊琴攝)　 草場的破壞者—高原鼠兔(王啟基攝)

曾被譽為“青藏高原生態環境的心臟”的青海湖，目前已經病入膏肓，危機重重。青海湖對青藏高原生態環境的“供血”功能失調，患嚴重“貧血”癥。青海湖的水位自 1956 ～ 1986 年的30 年內水位下降了 3.16m。原有 70 多條補給水源的河流，現在僅幸存 40 多條，水量比從前減少了近 60％，湖泊最深處水位已經由 20 世紀初期的 37.5m 下降至現在的 25m。青海湖流域土地沙化和草場退化非常嚴重，整體景觀正在由草地景觀向荒漠化景觀演變。同時，濕地退化也給青海湖流域的生物多樣性帶來嚴重威脅，使得物種不斷減少。云貴高原上著名的滇池一直處于嚴重的有機污染狀態，滇池的草海和外海局部水域在 1988 ～1990年連續 3 年有“水華”出現，藻類生長旺盛，進入 20 世紀 90 年代后，雖然國家已經將滇池列為國家重點治理的湖泊之一，并投入巨款進行了大力度的整治，但目前的污染狀況仍很嚴重，沒有得到有效的控制。